Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA2P29317 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms