Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IL3RAP26951 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL3RAP26951 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL3RAP26951 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms