Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTFP26441 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTFP26441 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTFP26441 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTFP26441 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTFP26441 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTFP26441 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTFP26441 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTFP26441 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTFP26441 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTFP26441 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTFP26441 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTFP26441 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTFP26441 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTFP26441 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTFP26441 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTFP26441 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTFP26441 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTFP26441 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTFP26441 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTFP26441 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTFP26441 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTFP26441 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTFP26441 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTFP26441 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTFP26441 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTFP26441 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTFP26441 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTFP26441 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTFP26441 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTFP26441 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTFP26441 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTFP26441 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTFP26441 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTFP26441 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTFP26441 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTFP26441 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTFP26441 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTFP26441 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTFP26441 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTFP26441 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTFP26441 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTFP26441 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTFP26441 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTFP26441 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTFP26441 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTFP26441 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTFP26441 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTFP26441 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms