Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA4P25789 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA4P25789 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMA4P25789 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms