Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3BP20337 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3BP20337 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3BP20337 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3BP20337 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3BP20337 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3BP20337 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3BP20337 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3BP20337 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3BP20337 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3BP20337 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB3BP20337 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3BP20337 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms