Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HMGA1P17096 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA1P17096 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGA1P17096 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms