Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB4P16144 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ITGB4P16144 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ITGB4P16144 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB4P16144 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGB4P16144 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGB4P16144 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGB4P16144 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGB4P16144 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms