Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYPP08247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPP08247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPP08247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPP08247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPP08247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYPP08247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPP08247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPP08247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPP08247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPP08247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYPP08247 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYPP08247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPP08247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPP08247 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPP08247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPP08247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPP08247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPP08247 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPP08247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPP08247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPP08247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPP08247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPP08247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPP08247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPP08247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPP08247 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPP08247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPP08247 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPP08247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPP08247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPP08247 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPP08247 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPP08247 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPP08247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPP08247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYPP08247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPP08247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPP08247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPP08247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPP08247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPP08247 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPP08247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPP08247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPP08247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPP08247 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPP08247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPP08247 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPP08247 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPP08247 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPP08247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPP08247 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPP08247 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPP08247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPP08247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms