Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGRP06401 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGRP06401 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGRP06401 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGRP06401 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGRP06401 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGRP06401 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGRP06401 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGRP06401 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGRP06401 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGRP06401 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGRP06401 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGRP06401 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGRP06401 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGRP06401 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGRP06401 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGRP06401 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGRP06401 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGRP06401 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGRP06401 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGRP06401 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGRP06401 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGRP06401 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGRP06401 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGRP06401 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGRP06401 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGRP06401 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGRP06401 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGRP06401 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGRP06401 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGRP06401 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGRP06401 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGRP06401 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGRP06401 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGRP06401 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGRP06401 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGRP06401 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms