Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPN1P04843 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPN1P04843 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPN1P04843 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPN1P04843 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPN1P04843 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RPN1P04843 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPN1P04843 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPN1P04843 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPN1P04843 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RPN1P04843 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPN1P04843 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPN1P04843 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPN1P04843 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPN1P04843 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPN1P04843 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPN1P04843 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPN1P04843 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPN1P04843 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPN1P04843 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPN1P04843 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPN1P04843 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPN1P04843 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPN1P04843 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPN1P04843 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RPN1P04843 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPN1P04843 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPN1P04843 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPN1P04843 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPN1P04843 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPN1P04843 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPN1P04843 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPN1P04843 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPN1P04843 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPN1P04843 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPN1P04843 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPN1P04843 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPN1P04843 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPN1P04843 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPN1P04843 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPN1P04843 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPN1P04843 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPN1P04843 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPN1P04843 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPN1P04843 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPN1P04843 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPN1P04843 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPN1P04843 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPN1P04843 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPN1P04843 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPN1P04843 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPN1P04843 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPN1P04843 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPN1P04843 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPN1P04843 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPN1P04843 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPN1P04843 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms