Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04436 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04436 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P04436 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04436 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04436 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P04436 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04436 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04436 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04436 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04436 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04436 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04436 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04436 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04436 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04436 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04436 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04436 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P04436 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P04436 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P04436 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P04436 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P04436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P04436 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04436 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P04436 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04436 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P04436 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P04436 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P04436 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P04436 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P04436 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04436 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04436 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04436 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04436 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04436 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04436 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04436 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04436 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04436 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04436 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04436 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P04436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04436 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04436 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04436 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04436 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P04436 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P04436 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04436 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04436 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms