Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSA2O95478 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSA2O95478 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSA2O95478 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSA2O95478 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSA2O95478 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSA2O95478 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSA2O95478 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSA2O95478 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSA2O95478 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSA2O95478 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSA2O95478 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSA2O95478 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSA2O95478 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSA2O95478 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSA2O95478 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSA2O95478 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSA2O95478 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSA2O95478 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSA2O95478 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSA2O95478 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NSA2O95478 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSA2O95478 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSA2O95478 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSA2O95478 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSA2O95478 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSA2O95478 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSA2O95478 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSA2O95478 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSA2O95478 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSA2O95478 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSA2O95478 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSA2O95478 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSA2O95478 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSA2O95478 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSA2O95478 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSA2O95478 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSA2O95478 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSA2O95478 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSA2O95478 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSA2O95478 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSA2O95478 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSA2O95478 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSA2O95478 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSA2O95478 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms