Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAPBO95292 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAPBO95292 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAPBO95292 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAPBO95292 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAPBO95292 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAPBO95292 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAPBO95292 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAPBO95292 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAPBO95292 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAPBO95292 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAPBO95292 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAPBO95292 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAPBO95292 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAPBO95292 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAPBO95292 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAPBO95292 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAPBO95292 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAPBO95292 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAPBO95292 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAPBO95292 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAPBO95292 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAPBO95292 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAPBO95292 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAPBO95292 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAPBO95292 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAPBO95292 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAPBO95292 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAPBO95292 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAPBO95292 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAPBO95292 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAPBO95292 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAPBO95292 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAPBO95292 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAPBO95292 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAPBO95292 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAPBO95292 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAPBO95292 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPBO95292 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPBO95292 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPBO95292 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAPBO95292 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAPBO95292 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAPBO95292 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPBO95292 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPBO95292 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPBO95292 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms