Protein–RNA interactions for Protein: O75940

SMNDC1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1O75940 TARDBP-217ENST00000616545 920 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-229ENST00000638264 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-226ENST00000621790 1008 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 510.07□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 59.93□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 39.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 58.46□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 57.36□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 29.2
SMNDC1O75940 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.425e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 520.34■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 514.95□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 214.52□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 313.55□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.481e-83■■■■■ 29.1
SMNDC1O75940 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.91□□□□□ -1.781e-86■■■■■ 28.9
SMNDC1O75940 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28.9
SMNDC1O75940 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 212.9□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.9
SMNDC1O75940 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 28.9
SMNDC1O75940 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 516.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 28.9
SMNDC1O75940 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.091e-323■■■■■ 28.7
SMNDC1O75940 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 28.7
SMNDC1O75940 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 514.95□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 225.38■■□□□ 1.653e-12■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.213e-12■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.083e-12■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.059e-8■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 520.23■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 219.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.73e-12■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.73e-12■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZNF276-203ENST00000561536 1947 ntTSL 218.96■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 WDR27-210ENST00000496752 1562 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 316.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 316.13■□□□□ 0.172e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 316.08■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 WDR27-207ENST00000476322 779 ntTSL 315.4■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 415.07■□□□□ 02e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.027e-11■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CALR-205ENST00000587486 957 ntTSL 214.94□□□□□ -0.029e-11■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 HELLS-207ENST00000419900 711 ntTSL 314.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 212.74□□□□□ -0.379e-11■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 512.52□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 28.6
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SMNDC1O75940 CENPK-216ENST00000515497 653 ntTSL 311.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.562e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 211.56□□□□□ -0.562e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 AATK-206ENST00000572798 407 ntTSL 211.52□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.662e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 510.89□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 ABCB6-213ENST00000497882 3008 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 GGA3-211ENST00000582232 598 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 310.02□□□□□ -0.817e-11■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-24■■■■■ 28.6
SMNDC1O75940 CENPK-217ENST00000515873 279 ntTSL 59.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 28.6
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