RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-205ENST00000485002 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.76■■■□□ 2.03
MEGF6-205ENST00000485002 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.61■■□□□ 1.85
MEGF6-205ENST00000485002 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MEGF6-205ENST00000485002 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.61■■□□□ 1.69
MEGF6-205ENST00000485002 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.03■■□□□ 1.6
MEGF6-205ENST00000485002 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-205ENST00000485002 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MEGF6-205ENST00000485002 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MEGF6-205ENST00000485002 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MEGF6-205ENST00000485002 HRCP23327 699 aa24.4■■□□□ 1.5
MEGF6-205ENST00000485002 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEGF6-205ENST00000485002 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
MEGF6-205ENST00000485002 MYT1Q01538 1121 aa24.13■■□□□ 1.45
MEGF6-205ENST00000485002 APLP2Q06481 763 aa24.12■■□□□ 1.45
MEGF6-205ENST00000485002 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MEGF6-205ENST00000485002 TRIM41Q8WV44 630 aa24.06■■□□□ 1.44
MEGF6-205ENST00000485002 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
MEGF6-205ENST00000485002 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
MEGF6-205ENST00000485002 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.83■■□□□ 1.41
MEGF6-205ENST00000485002 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
MEGF6-205ENST00000485002 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.7■■□□□ 1.38
MEGF6-205ENST00000485002 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MEGF6-205ENST00000485002 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.51■■□□□ 1.35
MEGF6-205ENST00000485002 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
MEGF6-205ENST00000485002 NEFLP07196 543 aa23.33■■□□□ 1.32
MEGF6-205ENST00000485002 ABCC9O60706 1549 aa23.24■■□□□ 1.31
MEGF6-205ENST00000485002 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
MEGF6-205ENST00000485002 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
MEGF6-205ENST00000485002 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
MEGF6-205ENST00000485002 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
MEGF6-205ENST00000485002 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.04■■□□□ 1.28
MEGF6-205ENST00000485002 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
MEGF6-205ENST00000485002 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.93■■□□□ 1.26
MEGF6-205ENST00000485002 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MEGF6-205ENST00000485002 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 12.9
MEGF6-205ENST00000485002 ITGAEP38570 1179 aa22.8■■□□□ 1.24
MEGF6-205ENST00000485002 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
MEGF6-205ENST00000485002 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MEGF6-205ENST00000485002 SCRIBQ14160 1630 aa22.6■■□□□ 1.21
MEGF6-205ENST00000485002 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.6■■□□□ 1.21
MEGF6-205ENST00000485002 NEUROD1Q13562 356 aa22.48■■□□□ 1.19
MEGF6-205ENST00000485002 BCANQ96GW7 911 aa22.45■■□□□ 1.18
MEGF6-205ENST00000485002 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.36■■□□□ 1.17
MEGF6-205ENST00000485002 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MEGF6-205ENST00000485002 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.3■■□□□ 1.16
MEGF6-205ENST00000485002 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
MEGF6-205ENST00000485002 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
MEGF6-205ENST00000485002 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.22■■□□□ 1.15
MEGF6-205ENST00000485002 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MEGF6-205ENST00000485002 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MEGF6-205ENST00000485002 ANP32CO43423 234 aa22.17■■□□□ 1.14
MEGF6-205ENST00000485002 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
MEGF6-205ENST00000485002 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.11■■□□□ 1.13
MEGF6-205ENST00000485002 NACADO15069 1562 aa22.02■■□□□ 1.12
MEGF6-205ENST00000485002 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.01■■□□□ 1.11
MEGF6-205ENST00000485002 FKBP8Q14318 412 aa21.95■■□□□ 1.11
MEGF6-205ENST00000485002 MIER1Q8N108 512 aa21.94■■□□□ 1.1
MEGF6-205ENST00000485002 TRIM52Q96A61 297 aa21.93■■□□□ 1.1
MEGF6-205ENST00000485002 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.8■■□□□ 1.08
MEGF6-205ENST00000485002 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
MEGF6-205ENST00000485002 P3H3Q8IVL6 736 aa21.74■■□□□ 1.07
MEGF6-205ENST00000485002 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
MEGF6-205ENST00000485002 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
MEGF6-205ENST00000485002 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.68■■□□□ 1.06
MEGF6-205ENST00000485002 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
MEGF6-205ENST00000485002 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
MEGF6-205ENST00000485002 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.61■■□□□ 1.05
MEGF6-205ENST00000485002 TONSLQ96HA7 1378 aa21.57■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 EEA1Q15075 1411 aa21.56■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.55■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 FBLN2P98095 1184 aa21.53■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MEGF6-205ENST00000485002 CLIP1P30622 1438 aa21.51■■□□□ 1.03
MEGF6-205ENST00000485002 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MEGF6-205ENST00000485002 CEP162Q5TB80 1403 aa21.5■■□□□ 1.03
MEGF6-205ENST00000485002 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.48■■□□□ 1.03
MEGF6-205ENST00000485002 ARID3CA6NKF2 412 aa21.45■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 GOLGA3Q08378 1498 aa21.45■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 NBR1Q14596 966 aa21.42■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.41■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
MEGF6-205ENST00000485002 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.37■■□□□ 1.01
MEGF6-205ENST00000485002 BCL11AQ9H165 835 aa21.36■■□□□ 1.01
MEGF6-205ENST00000485002 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
MEGF6-205ENST00000485002 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
MEGF6-205ENST00000485002 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.32■■□□□ 1
MEGF6-205ENST00000485002 MRS2Q9HD23 443 aa21.31■■□□□ 1
MEGF6-205ENST00000485002 SOGA1O94964 1423 aa21.3■■□□□ 1
MEGF6-205ENST00000485002 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
MEGF6-205ENST00000485002 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.29■■□□□ 1
MEGF6-205ENST00000485002 WIZO95785 1651 aa21.24■□□□□ 0.99
MEGF6-205ENST00000485002 KIF27Q86VH2 1401 aa21.23■□□□□ 0.99
MEGF6-205ENST00000485002 ABCC8Q09428 1581 aa21.21■□□□□ 0.99
MEGF6-205ENST00000485002 TMC1Q8TDI8 760 aa21.2■□□□□ 0.98
MEGF6-205ENST00000485002 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
MEGF6-205ENST00000485002 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms