RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496752.1

WDR27-210, Transcript of WD repeat domain 27, humanhuman

TSL 5

Gene WDR27, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR27-210ENST00000496752 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.43■■■■■ 4.38
WDR27-210ENST00000496752 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.07■■■■□ 3.52
WDR27-210ENST00000496752 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
WDR27-210ENST00000496752 ABCC9O60706 1549 aa35.28■■■■□ 3.24
WDR27-210ENST00000496752 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.21■■■■□ 3.23
WDR27-210ENST00000496752 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.1■■■■□ 3.21
WDR27-210ENST00000496752 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.79■■■■□ 3.16
WDR27-210ENST00000496752 NACADO15069 1562 aa34.63■■■■□ 3.13
WDR27-210ENST00000496752 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.43■■■■□ 3.1
WDR27-210ENST00000496752 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.39■■■■□ 3.1
WDR27-210ENST00000496752 SCRIBQ14160 1630 aa34.03■■■■□ 3.04
WDR27-210ENST00000496752 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.55■■■□□ 2.96
WDR27-210ENST00000496752 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.28■■■□□ 2.92
WDR27-210ENST00000496752 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.26■■■□□ 2.92
WDR27-210ENST00000496752 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
WDR27-210ENST00000496752 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.96■■■□□ 2.87
WDR27-210ENST00000496752 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
WDR27-210ENST00000496752 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
WDR27-210ENST00000496752 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.74■■■□□ 2.83
WDR27-210ENST00000496752 SMARCA4P51532 1647 aa32.63■■■□□ 2.81
WDR27-210ENST00000496752 WIZO95785 1651 aa32.44■■■□□ 2.78
WDR27-210ENST00000496752 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
WDR27-210ENST00000496752 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.26■■■□□ 2.75
WDR27-210ENST00000496752 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
WDR27-210ENST00000496752 SMARCA2P51531 1590 aa32.18■■■□□ 2.74
WDR27-210ENST00000496752 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
WDR27-210ENST00000496752 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
WDR27-210ENST00000496752 NCAPD3P42695 1498 aa31.98■■■□□ 2.71
WDR27-210ENST00000496752 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.9■■■□□ 2.7
WDR27-210ENST00000496752 HMGXB3Q12766 1538 aa31.88■■■□□ 2.69
WDR27-210ENST00000496752 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.83■■■□□ 2.69
WDR27-210ENST00000496752 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.54■■■□□ 2.64
WDR27-210ENST00000496752 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.33■■■□□ 2.61
WDR27-210ENST00000496752 CFTRP13569 1480 aa31.19■■■□□ 2.58
WDR27-210ENST00000496752 TRIM41Q8WV44 630 aa31.17■■■□□ 2.58
WDR27-210ENST00000496752 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.16■■■□□ 2.58
WDR27-210ENST00000496752 ABCC8Q09428 1581 aa31.02■■■□□ 2.56
WDR27-210ENST00000496752 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
WDR27-210ENST00000496752 PRDM2Q13029 1718 aa30.92■■■□□ 2.54
WDR27-210ENST00000496752 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.91■■■□□ 2.54
WDR27-210ENST00000496752 NESP48681 1621 aa30.88■■■□□ 2.53
WDR27-210ENST00000496752 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.78■■■□□ 2.52
WDR27-210ENST00000496752 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR27-210ENST00000496752 SYNJ1O43426 1573 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR27-210ENST00000496752 TOP2BQ02880 1626 aa30.66■■■□□ 2.5
WDR27-210ENST00000496752 CUX1P39880 1505 aa30.63■■■□□ 2.49
WDR27-210ENST00000496752 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.61■■■□□ 2.49
WDR27-210ENST00000496752 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.61■■■□□ 2.49
WDR27-210ENST00000496752 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
WDR27-210ENST00000496752 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.47■■■□□ 2.47
WDR27-210ENST00000496752 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.45■■■□□ 2.46
WDR27-210ENST00000496752 SOGA1O94964 1423 aa30.44■■■□□ 2.46
WDR27-210ENST00000496752 TOPBP1Q92547 1522 aa30.4■■■□□ 2.46
WDR27-210ENST00000496752 EEA1Q15075 1411 aa30.4■■■□□ 2.46
WDR27-210ENST00000496752 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
WDR27-210ENST00000496752 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.34■■■□□ 2.45
WDR27-210ENST00000496752 ERCC6Q03468 1493 aa30.32■■■□□ 2.44
WDR27-210ENST00000496752 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.32■■■□□ 2.44
WDR27-210ENST00000496752 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.31■■■□□ 2.44
WDR27-210ENST00000496752 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.3■■■□□ 2.44
WDR27-210ENST00000496752 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.28■■■□□ 2.44
WDR27-210ENST00000496752 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
WDR27-210ENST00000496752 KIF27Q86VH2 1401 aa30.2■■■□□ 2.42
WDR27-210ENST00000496752 CUX2O14529 1486 aa30.13■■■□□ 2.41
WDR27-210ENST00000496752 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.13■■■□□ 2.41
WDR27-210ENST00000496752 WDR62O43379 1518 aa30.12■■■□□ 2.41
WDR27-210ENST00000496752 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.09■■■□□ 2.41
WDR27-210ENST00000496752 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.08■■■□□ 2.41
WDR27-210ENST00000496752 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
WDR27-210ENST00000496752 IGF1RP08069 1367 aa29.94■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 GOLGA3Q08378 1498 aa29.94■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 KIF21BO75037 1637 aa29.94■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 WDR97A6NE52 1622 aa29.92■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 IFT140Q96RY7 1462 aa29.91■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
WDR27-210ENST00000496752 PRXQ9BXM0 1461 aa29.89■■■□□ 2.37
WDR27-210ENST00000496752 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
WDR27-210ENST00000496752 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.84■■■□□ 2.37
WDR27-210ENST00000496752 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.82■■■□□ 2.36
WDR27-210ENST00000496752 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.82■■■□□ 2.36
WDR27-210ENST00000496752 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.81■■■□□ 2.36
WDR27-210ENST00000496752 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
WDR27-210ENST00000496752 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.8■■■□□ 2.36
WDR27-210ENST00000496752 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
WDR27-210ENST00000496752 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
WDR27-210ENST00000496752 CUL7Q14999 1698 aa29.68■■■□□ 2.34
WDR27-210ENST00000496752 GRIN2BQ13224 1484 aa29.65■■■□□ 2.34
WDR27-210ENST00000496752 CEP162Q5TB80 1403 aa29.6■■■□□ 2.33
WDR27-210ENST00000496752 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
WDR27-210ENST00000496752 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
WDR27-210ENST00000496752 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.52■■■□□ 2.32
WDR27-210ENST00000496752 CLIP1P30622 1438 aa29.45■■■□□ 2.31
WDR27-210ENST00000496752 ADAMTS12P58397 1594 aa29.44■■■□□ 2.3
WDR27-210ENST00000496752 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.44■■■□□ 2.3
WDR27-210ENST00000496752 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
WDR27-210ENST00000496752 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
WDR27-210ENST00000496752 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
WDR27-210ENST00000496752 SYNJ2O15056 1496 aa29.3■■■□□ 2.28
WDR27-210ENST00000496752 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms