Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT3O75175 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT3O75175 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms