Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGSF3O75054 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF3O75054 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF3O75054 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF3O75054 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms