Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MITFO75030 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MITFO75030 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MITFO75030 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MITFO75030 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MITFO75030 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MITFO75030 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MITFO75030 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MITFO75030 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MITFO75030 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MITFO75030 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MITFO75030 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MITFO75030 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MITFO75030 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MITFO75030 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MITFO75030 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MITFO75030 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MITFO75030 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MITFO75030 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MITFO75030 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MITFO75030 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MITFO75030 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MITFO75030 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MITFO75030 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MITFO75030 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MITFO75030 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MITFO75030 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MITFO75030 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MITFO75030 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MITFO75030 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MITFO75030 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MITFO75030 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MITFO75030 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MITFO75030 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MITFO75030 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MITFO75030 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MITFO75030 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MITFO75030 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms