Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC50.49■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC50.47■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC50.45■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.44■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.67
ABCC9O60706 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC50.41■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.4■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCC9O60706 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC50.37■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC50.34■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC50.32■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC50.31■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC50.31■■■■■ 5.65
ABCC9O60706 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC50.31■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC50.31■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC50.29■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC50.28■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC50.28■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
ABCC9O60706 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC50.23■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC50.23■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC50.22■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC50.22■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
ABCC9O60706 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC50.19■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC50.17■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.13■■■■■ 5.62
ABCC9O60706 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.1■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC50.08■■■■■ 5.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 682 ms