Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM3APO60318 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3APO60318 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM3APO60318 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms