Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB5O43674 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms