Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC8O43402 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC8O43402 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC8O43402 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC8O43402 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC8O43402 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC8O43402 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC8O43402 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC8O43402 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC8O43402 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC8O43402 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC8O43402 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC8O43402 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC8O43402 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC8O43402 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC8O43402 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC8O43402 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC8O43402 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC8O43402 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC8O43402 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC8O43402 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC8O43402 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC8O43402 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC8O43402 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC8O43402 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC8O43402 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC8O43402 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC8O43402 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC8O43402 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC8O43402 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC8O43402 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC8O43402 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC8O43402 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC8O43402 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC8O43402 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC8O43402 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC8O43402 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC8O43402 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC8O43402 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC8O43402 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC8O43402 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC8O43402 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMC8O43402 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms