Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7O15265 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN7O15265 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms