Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0C1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0C1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0C1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0C1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0C1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0C1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0C1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0C1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0C1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0C1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0C1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0C1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0C1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C0C1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C0C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C0C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C0C1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C0C1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C0C1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0C1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0C1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0C1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0C1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0C1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0C1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0C1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0C1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H7C0C1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0C1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms