Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM23A6NLE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM23A6NLE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM23A6NLE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms