Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms