Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RCCD1A6NED2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCCD1A6NED2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCCD1A6NED2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCCD1A6NED2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms