Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCDC2BA2VCK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC2BA2VCK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC2BA2VCK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms