Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GVG6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GVG6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVG6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVG6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms