Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCSO14618 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCSO14618 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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