Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRYD3Q8NCJ5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms