Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms