Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms