RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446477.6

PRRT4-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRRT4, Length 3,544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-201ENST00000446477 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.09■■■□□ 2.89
PRRT4-201ENST00000446477 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.84■■■□□ 2.53
PRRT4-201ENST00000446477 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
PRRT4-201ENST00000446477 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
PRRT4-201ENST00000446477 ABCC9O60706 1549 aa28.34■■■□□ 2.13
PRRT4-201ENST00000446477 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.05■■■□□ 2.08
PRRT4-201ENST00000446477 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PRRT4-201ENST00000446477 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
PRRT4-201ENST00000446477 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PRRT4-201ENST00000446477 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.46■■□□□ 1.99
PRRT4-201ENST00000446477 HRCP23327 699 aa27.24■■□□□ 1.95
PRRT4-201ENST00000446477 MYT1Q01538 1121 aa27.2■■□□□ 1.95
PRRT4-201ENST00000446477 SCRIBQ14160 1630 aa27.2■■□□□ 1.95
PRRT4-201ENST00000446477 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.94■■□□□ 1.9
PRRT4-201ENST00000446477 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT4-201ENST00000446477 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PRRT4-201ENST00000446477 TRIM41Q8WV44 630 aa26.81■■□□□ 1.88
PRRT4-201ENST00000446477 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRRT4-201ENST00000446477 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PRRT4-201ENST00000446477 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.55■■□□□ 1.84
PRRT4-201ENST00000446477 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT4-201ENST00000446477 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PRRT4-201ENST00000446477 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PRRT4-201ENST00000446477 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.21■■□□□ 1.79
PRRT4-201ENST00000446477 NACADO15069 1562 aa26.17■■□□□ 1.78
PRRT4-201ENST00000446477 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.17■■□□□ 1.78
PRRT4-201ENST00000446477 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.14■■□□□ 1.77
PRRT4-201ENST00000446477 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PRRT4-201ENST00000446477 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.03■■□□□ 1.76
PRRT4-201ENST00000446477 WIZO95785 1651 aa25.77■■□□□ 1.72
PRRT4-201ENST00000446477 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PRRT4-201ENST00000446477 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.53■■□□□ 1.68
PRRT4-201ENST00000446477 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT4-201ENST00000446477 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PRRT4-201ENST00000446477 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRRT4-201ENST00000446477 BCL11AQ9H165 835 aa25.42■■□□□ 1.66
PRRT4-201ENST00000446477 ABCC8Q09428 1581 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT4-201ENST00000446477 NEUROD1Q13562 356 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT4-201ENST00000446477 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PRRT4-201ENST00000446477 APLP2Q06481 763 aa25.34■■□□□ 1.65
PRRT4-201ENST00000446477 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PRRT4-201ENST00000446477 P3H3Q8IVL6 736 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT4-201ENST00000446477 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.3■■□□□ 1.64
PRRT4-201ENST00000446477 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PRRT4-201ENST00000446477 ITGAEP38570 1179 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRT4-201ENST00000446477 SOGA1O94964 1423 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT4-201ENST00000446477 SMARCA4P51532 1647 aa25.21■■□□□ 1.63
PRRT4-201ENST00000446477 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.2■■□□□ 1.63
PRRT4-201ENST00000446477 ARID3CA6NKF2 412 aa25.18■■□□□ 1.62
PRRT4-201ENST00000446477 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRRT4-201ENST00000446477 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRRT4-201ENST00000446477 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.14■■□□□ 1.61
PRRT4-201ENST00000446477 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRT4-201ENST00000446477 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PRRT4-201ENST00000446477 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PRRT4-201ENST00000446477 FBLN2P98095 1184 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRT4-201ENST00000446477 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT4-201ENST00000446477 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
PRRT4-201ENST00000446477 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PRRT4-201ENST00000446477 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PRRT4-201ENST00000446477 SMARCA2P51531 1590 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT4-201ENST00000446477 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PRRT4-201ENST00000446477 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PRRT4-201ENST00000446477 NESP48681 1621 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT4-201ENST00000446477 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT4-201ENST00000446477 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT4-201ENST00000446477 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PRRT4-201ENST00000446477 CEP162Q5TB80 1403 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT4-201ENST00000446477 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PRRT4-201ENST00000446477 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PRRT4-201ENST00000446477 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT4-201ENST00000446477 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT4-201ENST00000446477 CUX2O14529 1486 aa24.5■■□□□ 1.51
PRRT4-201ENST00000446477 NCAPD3P42695 1498 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT4-201ENST00000446477 CLIP1P30622 1438 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT4-201ENST00000446477 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.43■■□□□ 1.5
PRRT4-201ENST00000446477 SYNJ1O43426 1573 aa24.41■■□□□ 1.5
PRRT4-201ENST00000446477 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.4■■□□□ 1.5
PRRT4-201ENST00000446477 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRRT4-201ENST00000446477 KIF27Q86VH2 1401 aa24.35■■□□□ 1.49
PRRT4-201ENST00000446477 GOLGA3Q08378 1498 aa24.34■■□□□ 1.49
PRRT4-201ENST00000446477 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.32■■□□□ 1.48
PRRT4-201ENST00000446477 ERCC6Q03468 1493 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT4-201ENST00000446477 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT4-201ENST00000446477 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT4-201ENST00000446477 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PRRT4-201ENST00000446477 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.21■■□□□ 1.47
PRRT4-201ENST00000446477 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.19■■□□□ 1.46
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PRRT4-201ENST00000446477 CFTRP13569 1480 aa24.17■■□□□ 1.46
PRRT4-201ENST00000446477 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.17■■□□□ 1.46
PRRT4-201ENST00000446477 CUX1P39880 1505 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRT4-201ENST00000446477 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PRRT4-201ENST00000446477 EEA1Q15075 1411 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT4-201ENST00000446477 IGF1RP08069 1367 aa24.09■■□□□ 1.45
PRRT4-201ENST00000446477 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
PRRT4-201ENST00000446477 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT4-201ENST00000446477 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.03■■□□□ 1.44
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