Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD3-BMI1R4GMX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD3-BMI1R4GMX3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms