Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NOP58Q9Y2X3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NOP58Q9Y2X3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NOP58Q9Y2X3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms