Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.71■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC58.71■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC58.7■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.7■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.7■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC58.68■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.65■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC58.65■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.63■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.63■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC58.63■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58.62■■■■■ 6.98
NISCHQ9Y2I1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC58.62■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC58.62■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.62■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC58.61■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC58.61■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.61■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC58.61■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.61■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.59■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC58.59■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.59■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC58.59■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC58.58■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC58.58■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC58.57■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.57■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC58.56■■■■■ 6.97
NISCHQ9Y2I1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.56■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC58.56■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC58.55■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.54■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.54■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.54■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC58.52■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC58.52■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC58.52■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.51■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.51■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.51■■■■■ 6.96
NISCHQ9Y2I1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.49■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC58.49■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.49■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC58.48■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.48■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.47■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC58.47■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.47■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC58.47■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC58.47■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC58.46■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.45■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC58.45■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.44■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.44■■■■■ 6.95
NISCHQ9Y2I1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC58.43■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC58.42■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC58.41■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.4■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC58.4■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC58.4■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.4■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC58.38■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58.38■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC58.38■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC58.38■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC58.38■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC58.37■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.37■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC58.37■■■■■ 6.94
NISCHQ9Y2I1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC58.37■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.36■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.35■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC58.35■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC58.34■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC58.33■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC58.32■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC58.32■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC58.32■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC58.32■■■■■ 6.93
NISCHQ9Y2I1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.28■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC58.28■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.28■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.28■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC58.27■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.27■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.27■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC58.27■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC58.26■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.26■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.26■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC58.26■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.25■■■■■ 6.92
NISCHQ9Y2I1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.24■■■■■ 6.91
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