Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASF1AQ9Y294 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1AQ9Y294 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1AQ9Y294 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms