Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCOLCE2Q9UKZ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCE2Q9UKZ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms