Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFA12Q9UI09 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA12Q9UI09 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA12Q9UI09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms