Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4Q9UBX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4Q9UBX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms