Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMCD1Q9NZU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMCD1Q9NZU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms