Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1BQ9NZR2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms