Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDE1Q9NZC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDE1Q9NZC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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