Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23BQ9NYZ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23BQ9NYZ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms