Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ACKR4Q9NPB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR4Q9NPB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR4Q9NPB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms