Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4CQ9C0C4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4CQ9C0C4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms