Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNG6Q9BXT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG6Q9BXT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms