Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms