Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD2AQ9BW72 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms